环境与生物工程学院成立于1999年，设有环境工程系、生物工程系、化学工程系、食品工程系、基础化学部和实践教学中心等6个教学单位；学院具备从本科到硕士的人才培养体系，开设环境工程、生物技术、应用化学和食品质量与安全等4个本科专业，在校本科生1069人；2021年获批设立资源与环境专业硕士学位授权点，主要培养环境工程领域硕士研究生；教学科研条件较完善，实验室面积约5775 m2，仪器设备总值约4700万元。

学院拥有一支优秀的师资队伍，现有专任教师67位，高级职称教师51人，其中教授15人，副教授34人，高级工程师2人；博士49人，硕士14人，硕士生校内导师69人；享受国务院特殊津贴专家1人，省级高层次人才10人，福建省高校新世纪优秀人才支持计划3人，福建省高校杰出青年科研人才计划4人，壶兰学者1人，莆田市第一批特殊支持高层次人才1人，莆田市科技创新领军人才1人，莆田市青年拔尖人才2人；已形成一支称职、学历、年龄及学缘结构合理，科研能力强、教学水平高的师资队伍。

学院拥有良好的人才培养平台，建有福建省绿色新材料现代产业学院、“环境工程”和“生物技术”两个福建省一流本科专业建设点、“应用化学”福建省高校服务地方产业特色专业、“环境工程”福建省本科高校专业综合改革试点、福建省应用化学专业人才培养模式创新实验区；福建省生物化工技术虚拟仿真试验教学中心、福建省基础化学公共基础课实验教学平台、福建省生物学实验教学示范中心、生物技术省级教学团队、校企合作共建应用化学专业省级大学生校外实践教育基地等11个省级教学平台；建有莆田市循环经济产业技术研究院1个市级平台；建有“生物与医药”专业硕士学位培育点、应用化学实验教学示范中心、环境工程实验教学示范中心、环境工程卓越人才培养试点、生物技术卓越人才培养试点、应用化学卓越人才培养试点等6个校级教学平台；质量工程建设取得新成效，建有1个生物技术省级教学团队，建有省级“课程思政”课程1门、省级精品在线开放课程1门、省级一流课程8门（含1门培育）。

学院拥有先进的科学研究平台，建有“生态环境”和“生物工程”两个省级重点学科、“环境科学与工程”省级应用型学科及一流应用型建设高校（A类）主干学科、福建省新型污染物生态毒理效应与控制重点实验室、生态环境及其信息图谱福建省高等学院重点实验室等6个省级学科平台；建有莆田学院环境科学与技术研究所、莆田学院海洋牧场与海岸带生态环境协同创新中心、莆田学院特色生物资源产业化工程协同创新中心等3个校级科研平台。

近三年，学院成功先后承办或协办近10场省级以上学术会议；新立项各类科研项目118项，经费共计1700余万元，其中国家自然科学基金项目1项，省部级重点项目4项；发表论文147篇，其中SCI收录43篇、EI收录8篇，授权发明专利18项。

学院十分重视提高学生的综合素质，近年来，学生参加各类学科竞赛、技能竞赛荣获国家级、省级奖励33项。毕业生近三年升学率约20%，就业率约91.5%。国内外深造院校包括比利时澳门理工大学、安徽大学、合肥工业大学、福州大学、暨南大学、太原理工大学、南京信息工程大学、山西大学、华侨大学、福建农林大学、福建师范大学等国内外知名学府；就业单位包括生态环境部环境规划院、福建省环境保护设计院有限公司、中国检验认证集团福建有限公司、湖北省环境科学研究院、浙江环能环境技术有限公司、云南水务投资股份有限公司、深圳市广汇源环境水务有限公司、福建南方制药股份有限公司、福建晋江热电有限公司等政府部门或知名企事业单位。

环境与生物工程学院正按照莆田学院确立的“应用型、地方性、开放式、特色化”的办学定位和“以应用为原则，以行业为依托，以专业为基础，整合资源，形成团队，产学协作，项目推动”的学科建设思路，坚持“服务需求、贴近产业、强化特色、错位发展”，以建设特色鲜明的一流应用型大学的目标而努力。