我校目前有 3 个医学类学院：基础医学院、护理学院、药学与医学技术学院；设有 6 个医学类本科专业：临床医学（本科、定向、专升本）、护理学（本科、闽台班、专升本）、助产学、药学（本科、专升本）、医学检验技术（本科、专升本）、医学影像技术。每年大致有 800-900 名学生分布于33 个临床教学基地实习，包括 1 个直属附属医院，2 个非直属附属医院，16 个教学医院，12 个实习基地和 2 个社区实践基地。

33 个临床教学基地分布于福建省九地市，其中福州市 7 个，莆田市 8 个，泉州市 4 个，厦门市 6 个，漳州市 1家，龙岩市 2 个，三明市 1 个，南平市 2 个，宁德市 2 个。其中三级甲等医院 22 个，三级乙等医院 3 个，三级综合性医院 5 个，专科医院 1 个，社区服务中心 2 个。